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医疗软件是现代化医院运营的必要技术支撑和基础设施，实现医疗软件的目的就是为了以更现代化、科学化、规范化的手段来加强医院的管理，提高医院的工作效率，改进医疗质量，从而树立现代医院的新形象，这也是未来医院发展的必然方向。
2004 年复软科技与中国海军建立长期合作伙伴关系，展开一系列的合作，共同推进中国海军信息化建设水平。已有医疗、物资、心理测评等军用软件研发，取得了实质性的成效。通过共同努力，不断拓展合作深度，把中国海军信息化建设推上一个新高度。
由全国著名的朱莉、吴乃川教授及多位医学专家进行需求分析，依托复旦大学资深教授及复软科技的技术力量，研制开发的一套“以病人为中心”，集信息流、数据流、物流、资金流为一体，功能全面的医院信息管理系统（HIS）。 医保结算版本完美支持上海医保结算，包含近三十个模块，覆盖了医院的方方面面，广泛采用分布式处理模型，减少了对硬件设施的依赖性。
复软中医诊所信息管理系统是整合了整个中医诊所的预约、挂号、医生工作站、中医病历、处方管理、健康档案、门诊日志、临床分析、财务管理、经营分析、医生提成、会员管理、短信平台、微信互动、药房及中药药材进销存一体化的管理系统。
