2004 年复软科技与中国海军医学研究所建立长期合作伙伴关系，就中国海军的医疗信息化建设展开一系列的合作，共同推进中国海军的医疗信息化建设水平。经过一年多的工作，第一阶段《XXX舰海上医疗救护与后送信息管理系统》已于2005年10月底顺利完成，经正式实施后，获得了军方认可。
第二阶段《XXX医疗信息管理系统》将与2009年交付使用，该系统是由中国海军医学研究所与复软科技共同研发的一套海上医疗救护与后送系统。系统将陆上的全套医院系统全面移植到医院船上，再根据医院船本身特色进行开发，使陆上医疗系统完全应用于医院船上。其最大特点即军民两用。
系统包含了基础设置、医疗救治、医技影像、手术、装备药材、血液管理、远程通信、组织指挥等10多个大类、30多个模块，广泛采用分布式处理模型，减少了对硬件设施的依赖性。在技术上该系统利用了最新的软件开发和数据库设计技术，是海军信息化、电子化发展趋势的体现。
中国海军医学研究所与复软科技对卓有成效的双方合作表示满意，已取得了实质性的成效。今后，双方更将以科学发展观为指导，继续加深双方的合作，通过共同努力，不断拓展合作深度，更贴近中国海军医疗信息化建设发展规划，扩大合作面，把中国海军医疗信息化建设推上一个新高度。
